Caption above longtable in multiply pages

If you want the bold column titles to appear in the first head too, you have to write them there as well, if that is what you meant by 'destroy'. And for setting the captions above tables neatly with some extra space, KOMA offers the option captions=tableheading.

Is this the style you are after?

documentclass[ngerman,12pt,listof=entryprefix,listof=totoc,captions=tableheading]{scrartcl}
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begin{document}
    blindtext[4]
    begin{longtable}{l|c|c|p{5.85cm}}
        caption{Adressbereiche der Modbus-Datenübertragung}label{tab:adressbereich_modbus}
        textbf{Objekttyp}  & textbf{Zugriff} & textbf{Größe} & textbf{Funktionscode} 
        hline hline
        endfirsthead
        caption*{Tabelle ref{tab:adressbereich_modbus} fortgeführt: Adressbereiche der Modbus-Datenübertragung}
        textbf{Objekttyp}  & textbf{Zugriff} & textbf{Größe} & textbf{Funktionscode} 
        hline hline
        endhead
        %
        Binäre Ausgänge  & Lesen & & 1 Bit     & $cdot$ FC 01: Lese Ausgangsbit Status  
        Coil&Schreiben&& $cdot$ FC 05: Schreibe Ausgangsbit 
        &&& $cdot$ FC 15: Schreibe mehrfach Ausgangsbit 
        hline
        Binäre Eingänge  & Lesen               & 1 Bit      & $cdot$ FC 02: Lese Eingangsbit Status 
        Discrete Input&&&
        hline
        Analoge Eingänge & Lesen               & 16 Bit     & $cdot$ FC 04: Lese Input-Register 
        Input Register&&&
        hline
        Analoge Ausgänge & Lesen &  & 16 Bit     & $cdot$ FC 03: Lese Holding-Register 
        Holding Register&Schreiben&& $cdot,,$FC 06: Schreibe Holding-Register 
        &&& $cdot,,$FC 16: Schreibe mehrfach Holding-Register 
        hline
        hline       
    end{longtable}
end{document}