One Hot Encoder con columna ID que no debe ser tocada ni modificada, ¿cómo proceder en Python?

Tengo una tabla que posee varias columnas: ID, Género, Región, Nivel Educacional, Edad, Comuna, y otras 25 más, y más de 100 mil registros, que a continuación comparto con una imagen de ejemplo (no puedo colocar todas las columnas porque poseen datos sensibles)…

Por lo tanto a la tabla debo hacer un "One Hot Encoder" a gran parte de las variables Objetos y Categóricos y a unas numéricas, pero a la columna ‘ID’ y a otras, como por ejemplo ‘Edad’, no se le debe aplicar el proceso, con el fin de poder crear un único archivo CSV con todas las columnas no transformadas y con las columnas resultantes del "One Hot Encoder" reemplacen a las columnas originales a las cuales se le aplicó.

Sé que se puede hacer con pandas.get_dummies pero no logro que todo quede en un mismo dataframe para luego guardar en un CSV nuevo.
Logro el One Hot Encoder con pandas, pero creando otro dataframe aparte con la instrucción…

cat_org = pd.get_dummies(dataframe[columns], drop_first = True, dummy_na = True)

donde ‘columns’ contiene las columnas que interesa aplicar el One Hot Encoder, pero no posee la columna ‘ID’ y temo que si junto con otra, se mezclen los datos y el resultado sea inservible.
Puede que esté perdido o ahogándome en un baso de agua, pero no logro lo que requiero.

Se agradece muchísimo la ayuda.

import pandas as pd

df = pd.DataFrame({'A': ['x', 'y', 'x'], 'B': ['z', 'u', 'z'],
                  'C': ['1', '2', '3'],
                  'D':['j', 'l', 'j']})

pd.get_dummies(df, columns=['A', 'B', 'D'])