Linha de tendencia em scatterplot no matplotlib em Python

Você pode fazer isso rapidamente através da função Polyfit do numpy.

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x = [548, 677, 987, 2, 29, 1114, 521, 999] 
y = [96, 775, 258, 369, 410, 99, 5, 1117]

plt.scatter(x, y)

z = np.polyfit(x, y, 1)
p = np.poly1d(z)
plt.plot(x,p(x),"r--")

Saída:

Essa que eu fiz é o basicão, mas dá pra fazer algumas coisas bem legais, como você pode ver aqui.