Arquivo sendo escrito em diversas listas!

Estou desenvolvendo um programa simples em python, onde eu preciso gerenciar o estoque de uma loja.
Quando tento fazer com que os produtos sejam salvos em uma unica lista, eles acabam sendo salvos em diversas, impossibilitando a leitura no .txt para a pesquisa dos produtos!
Alguém consegue me ajudar? Estou travado nisso à umas 8 horas.
O programa é simples e tem que ser feito em python, para um trabalho de faculdade.
OBRIGADO!!

import sys, json


arquivo = open('LOJA.txt', 'a+')
print("### Loja do Iago e Do Pedro ###")

produto=[] 

def menu():
    opcao = int(input('### MENU ###n1-Cadastro de Produtosn2-Pesquisar Produtosn3-Alterar um Produton4-Remover um Produton5-Listar Produtos em Ordem ALFABÉTICAn6-Listar Produtos Por CÓDIGOn'))
    if opcao==1:
        cadastro()
    elif opcao==2:
        nome=input('Digite o nome do produto: ')
        pesquisa(nome)
    elif opcao==3:
        alterar()
    elif opcao==4:
        nome=input('Digite o nome do produto que voce deseja remover: ')
        Remover(nome)
    elif opcao==5:
        alfabetica()
    elif opcao==6:
        codigos()
         
    

def cadastro():
    # arquivo = open('LOJA.txt', 'a+')
    qtd=int(input('Quantidade de produtos a serem cadastrados: '))
    for x in range(qtd):
        produto=[]
        nome = input('Nome do produto: ')
        codigo = input('Codigo do produto: ')
        quantidade = input('Quantidade do produto: ')
        produto = json.dumps((nome, codigo, quantidade))
        with open('LOJA.txt', 'a+') as file:
            file.write(str(produto)) 
    file.close()
 

def pesquisa(nome):
    # arquivo = open('LOJA.txt', 'r')
    produto = []
    with open('LOJA.txt','r') as file:
        produto = arquivo.readlines() # readlinesssssss
        # produto = eval(file.read())
        for i in range(len(produto)):
            if nome in produto[i][0]:
                print('Nome: %snCódigo: %snQuantidade: %s' % (produto[i][0], produto[i][1], produto[i][2]))
            else:
                print('Produto não encontrado!')
    file.close()

def alterar():
    arquivo = open('LOJA.txt', 'a+')
    produto = []
    with open('LOJA.txt','a+') as file:
        produto = eval(file.read())
    for i in range(len(produto)):
        if nome in produto[i][0]:
           print('Nome: %snCódigo: %snQuantidade: %s' % (produto[i][0], produto[i][1], produto[i][2]))
        else:
            print('Produto não encontrado!')
    file.close()

def Remover(nome):
    arquivo = open('LOJA.txt', 'w+')
    produto = []
    with open('LOJA.txt','r') as file:
        produto = eval(file.read())
        # produto = json.load(file)
    for i in range(len(produto)):
        if nome in produto[i][0]:
            del produto[i]
        else:
            print('Produto não encontrado')                
    file.close()

def alfabetica():
    arquivo = open('LOJA.txt', 'r')
    with open('LOJA.txt','r') as file:
        produtos=eval(file.read())
        produto_ordenados = sorted(produtos)
        print(produto_ordenados)
    file.close()

def codigos():
    arquivo = open('LOJA.txt', 'r')
    with open('LOJA.txt','r') as file:
        produto=eval(file.read())
        produtos=[produto]
        codigos_ordenados = sorted(produtos)
        print(codigos_ordenados)
    file.close()    
menu()