babelでtypescriptをコンパイルするのとtscでtypescriptをコンパイルするのにどのような違いがありますか？

babelでもpluginを用いればtypescriptをコンパイルできますが、tscを用いてコンパイルするのとは何が違うのでしょうか？

jsとtsが混在していてもtypescriptのtsconfigで allowJs を有効にすればtscでjavascriptもtypescriptもコンパイルできるので、素人目にはほとんど同じことができるような気がしています。

tscだとなにか困ることがあるからできるのだと思うのですが、調べきることができませんでした。